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DNA甲基化的檢測已經達到了單細胞的分辨率。不過,目前的方法還不能完整覆蓋 CpG,總是留下一些缺口。英國的一個團隊最近開發出一種計算方法,可準確填補這些缺口。 【更多】
N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一,在細菌、藻類及植物基因組中廣泛存在,在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發揮作用。6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富... 【更多】
液相雜交捕獲甲基化測序(Liquid Hybridization Capture-based Bisulfite Sequencing, LHC-BS)是將液相雜交捕獲技術和重亞硫酸鹽Bisulfite測序技術相結合,對目標序列進行單堿基分辨率的甲基化測序。目前較... 【更多】
全基因組甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測序技術相結合,對有參考基因組進行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測序,是DNA甲基化檢測的... 【更多】
羥甲基化DNA免疫沉淀測序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,hMeDIP-Seq)是通過5hmC特異性抗體富集羥甲基化的DNA片段,然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的... 【更多】
DNA羥甲基化(5hmC)是新發現的一種的修飾堿基,被稱為第六堿基。技術上Bisulfite測序并不能區分甲基化(5mC)和羥甲基化(5hmC),實際上是5mC 和5hmC 兩種修飾的混合信號,而通過氧化重亞硫酸鹽測序(... 【更多】
簡化基因組甲基化測序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS) 是通過限制性酶切的方法 富集基因組DNA上富含CCGG位點的片段,經Bisulfite處理和高通量測序技術 進行基因組CpG富集... 【更多】
甲基化DNA免疫沉淀測序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq)是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DNA片段,然后結合高通量測序技術在全基因組水平上以較小的數據量,快速、... 【更多】
背景簡介 簡化基因組測序(Reduced-Representation Genome Sequencing, RR GS)是對部分基因組進行序列測定。它是指利用生物信息學方法,設計標記開發方案,富集特異性長度片段,應用高通量測序技術獲得海量... 【更多】
轉錄組測序 (Transcriptome sequencing) 主要指通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉錄出來的 mRNA,用來研究基因結構和基因定量分析,并預測新轉錄本,是研究轉錄組復雜性的常用手段和工具。 【更多】
lncRNAs是一類長度大于200 nt的非編碼RNA,廣泛存在于各種生物體內,在表觀遺傳、轉錄以及轉錄后等多種水平上對生命活動進行關鍵性的調控。lncRNA測序檢測lncRNA的表達水平,識別新的lncRNA,可以有效... 【更多】
Small RNA是體內一種重要的調節分子,主要包括microRNA、siRNA、piRNA三類, 主要功能是誘導基因沉默。Small RNA 測序研究特定狀態下的所有已知 Small RNA,也可發現物種或組織特異 Small... 【更多】
染色質免疫共沉淀測序(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing, ChIP-Seq)是將染色質免疫共沉淀與高通量測序相結合的技術,研究蛋白質與DNA相互作用的經典手段。通過將測序獲得的數百萬條序列標簽精... 【更多】
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